قسم نظام المناطق منطقة نجران إلى ست محافظات، منها محافظة واحدة من الفئة (أ) وهي محافظة شرورة، وخمس محافظات من الفئة (ب) وهي: حبونا، وبدر الجنوب، ويدمة، وثار، وخباش.
أما عدد المراكز فبلغ 53 مركزًا، منها 24 مركزًا في الفئة (أ) و29 مركزًا في الفئة (ب).
